[ jchase@node08: Tue Oct 4 13:43:51 2016 ] /home/anoble/myami/appion/bin/protomo2reconstruction.py \ --ctf_correct=False --amp_contrast=0.07 --iWidth=20 --DefocusTol=200 \ --dose_presets=False --frame_aligned=True --recon_iter=90 --reconstruction_method=4 \ --recon_map_sampling=1 --runname=tiltseries0007 \ --rundir=/gpfs/appion/jchase/16sep28d/protomo_alignments/tiltseries0007 \ --pixelsize=1.76302 --tiltseries=7 --sessionname=16sep28d --projectid=45 \ --expid=2667 --jobtype=protomo [ jchase@node14: Tue Oct 25 11:58:57 2016 ] /home/anoble/myami/appion/bin/protomo2reconstruction.py \ --dose_presets=Moderate --stack_procs=all --negative_recon=-43 \ --positive_recon=46 --recon_iter=58 --reconstruction_actions=3 \ --reconstruction_method=4 --recon_map_sampling=1 --bin_type=sum \ --runname=tiltseries0003 \ --rundir=/gpfs/appion/jchase/16sep28d/protomo_alignments/tiltseries0003 \ --pixelsize=1.76302 --tiltseries=3 --sessionname=16sep28d --projectid=45 \ --expid=2667 --jobtype=protomo