[ jchase@node08: Wed Oct  5 19:45:07 2016 ]
/home/anoble/myami/appion/bin/protomo2reconstruction.py \
  --ctf_correct=False --amp_contrast=0.07 --iWidth=20 --DefocusTol=200 \
  --dose_presets=False --tomo3d_procs=all --tomo3d_sirt_iters=30 \
  --frame_aligned=True --recon_iter=60 --reconstruction_method=3 \
  --recon_map_sampling=24 --recon_thickness=1000 --runname=tiltseries0005 \
  --rundir=/gpfs/appion/jchase/16sep28d/protomo_alignments/tiltseries0005 \
  --pixelsize=1.76302 --tiltseries=5 --sessionname=16sep28d --projectid=45 \
  --expid=2667 --jobtype=protomo