++++ Executing new job on Thu Jan 13 07:31:12 2022 ++++ with the following command(s): `which relion_refine_mpi` --o Refine3D/job069/run --auto_refine --split_random_halves --i Refine3D/job068/run_data.star --ref Refine3D/job068/run_class001.mrc --ini_high 4.5 --dont_combine_weights_via_disc --scratch_dir $RELION_SCRATCH_DIR --pool 30 --pad 2 --skip_gridding --ctf --particle_diameter 220 --flatten_solvent --zero_mask --solvent_mask MaskCreate/job067/mask.mrc --solvent_correct_fsc --oversampling 1 --healpix_order 3 --auto_local_healpix_order 4 --offset_range 5 --offset_step 2 --sym C1 --low_resol_join_halves 40 --norm --scale --helix --helical_outer_diameter 180 --helical_nr_asu 3 --helical_twist_initial -0.9 --helical_rise_initial 4.75 --helical_z_percentage 0.2 --helical_symmetry_search --helical_twist_min -0.6 --helical_twist_max -1.2 --helical_twist_inistep 0.01 --helical_rise_min 4.65 --helical_rise_max 4.95 --helical_rise_inistep 0.01 --sigma_tilt 5 --sigma_psi 3.33333 --sigma_rot 0 --helical_keep_tilt_prior_fixed --j 8 --gpu "" --pipeline_control Refine3D/job069/ ++++